F. X. Nguyen Van Thuan bol trinásť rokov väznený, deväť rokov strávil v izolácii. Nikdy neprebehol súdny proces, ani nebol vydaný rozsudok. Vláda bola zúfalá z vnútornej premeny jeho dozorcov, ktorých miloval až nad rámec logiky. Po prepustení bol nútený žiť v exile.
V r. 2001 bol v Ríme vymenovaný za kardinála, zomrel 16. septembra 2002. Presne po piatich rokoch od smrti sa začal proces jeho blahorečenia. V máji 2017 mu pápež František priznal titul ctihodný.
Diela, ktoré napísal počas svojho zajatia, sa rozšírili na všetky kontinenty a boli preložené do mnohých jazykov.
